Posted by on 9 września 2018

Dolna część panelu pokazuje liczbę kopii DNA wyrażoną w skali logarytmicznej o podstawie 2 (stosunek kłody), z czerwoną linią odpowiadającą dwóm kopiom DNA. Aby wyszukać zmiany genów, które mogą powodować niekontrolowany kortykotropinę makroskopowy przerost nadnerczy, wykorzystaliśmy macierze SNP do przeszukiwania genomewidów zmian chromosomalnych w 34 próbkach nowotworów uzyskanych od 26 pacjentów z niezależnym od kortykotropiny makronodularnym przerostem kory nadnerczy, którzy przeszli operację. Nawracające zmiany chromosomów somatycznych w guzkach od pacjentów były rzadkie (ryc. S3 i tabele S2, S3 i S4 w dodatkowym dodatku), z wyjątkiem 16 pensów (ryc. 1). Obojętną pod względem kopii utratę heterozygotyczności zidentyfikowano w 10 z 34 próbek nowotworów (29%) uzyskanych od 7 z 26 pacjentów (27%). Ponadto, somatyczna utrata heterozygotyczności w 16 p11. wykrywano za pomocą markerów mikrosatelitarnych u z 7 innych pacjentów (tabela S5 w dodatkowym dodatku); tak więc utratę heterozygotyczności wykryto przy 16p u 8 z 33 pacjentów (24%) z niezależnym od kortykotropiny makronodularnym przerostem kory nadnerczy.
Sekwencjonowanie całego genomu w pięciu sparowanych próbkach DNA guza i leukocytów zidentyfikowało mutacje somatyczne wpływające na sekwencję kodującą 85 genów i warianty strukturalne wpływające na sekwencję kodującą 12 genów (Tabele S6, S7 i S8 w Dodatku Uzupełniającym). Tylko gen, ARMC5, który mapuje do 16p11.2, został zmodyfikowany w więcej niż jednej próbce guza; Próbki guza uzyskane od trzech pacjentów miały mutację. Mutacje somatyczne ARMC5 obejmowały dwie mutacje zmiany ramki odczytu i jedną mutację missense. Mutacje te potwierdzono za pomocą sekwencjonowania Sangera.
Figura 2. Figura 2. Zmiany ARMC5 w DNA leukocytów i guza. Panel A pokazuje dwie zmiany ARMC5 wykryte w DNA nowotworu uzyskane od 18 pacjentów. Analiza DNA leukocytów (lewa kolumna) pokazuje zmianę linii płciowej (niebieskie pole). Każdy nowotwór pod Warianty somatyczne w różnych nowotworach pokazano jako pudełko z niebieskim prostokątem (pokazującym zmianę w DNA leukocytów) i żółtym prostokącie (pokazującym zmianę, która jest wykrywana tylko w DNA nowotworu). DNA linii komórkowej od 4 pacjentów nie było dostępne (prawy dolny róg). Panel B pokazuje analizę Western blot białka ARMC5 w ludzkiej linii komórkowej adrenokortów H295R transfekowanych kontrolnym małym interferującym RNA (siRNA) lub siRNA ARMC5 (po lewej), 3 prawidłowymi gruczołami nadnerczy (w środku) i 17 próbami uzyskanymi od pacjentów z niezależnym od kortykotropiny makronodularnym przerost nadnerczy (po prawej): 7 bez zmiany ARMC5 i 10 z różnymi typami zmian ARMC5. LOH oznacza utratę heterozygotyczności, LT lewego guza i RT prawego guza.
Bezpośrednie sekwencjonowanie DNA nowotworu zidentyfikowało mutacje ARMC5 u 18 z 33 pacjentów (55%)
[hasła pokrewne: kalendarz zbioru ziół, przeciwwskazania do masażu, medycyna na ukrainie opinie ]

Powiązane tematy z artykułem: kalendarz zbioru ziół medycyna na ukrainie opinie przeciwwskazania do masażu

Posted by on 9 września 2018

Dolna część panelu pokazuje liczbę kopii DNA wyrażoną w skali logarytmicznej o podstawie 2 (stosunek kłody), z czerwoną linią odpowiadającą dwóm kopiom DNA. Aby wyszukać zmiany genów, które mogą powodować niekontrolowany kortykotropinę makroskopowy przerost nadnerczy, wykorzystaliśmy macierze SNP do przeszukiwania genomewidów zmian chromosomalnych w 34 próbkach nowotworów uzyskanych od 26 pacjentów z niezależnym od kortykotropiny makronodularnym przerostem kory nadnerczy, którzy przeszli operację. Nawracające zmiany chromosomów somatycznych w guzkach od pacjentów były rzadkie (ryc. S3 i tabele S2, S3 i S4 w dodatkowym dodatku), z wyjątkiem 16 pensów (ryc. 1). Obojętną pod względem kopii utratę heterozygotyczności zidentyfikowano w 10 z 34 próbek nowotworów (29%) uzyskanych od 7 z 26 pacjentów (27%). Ponadto, somatyczna utrata heterozygotyczności w 16 p11. wykrywano za pomocą markerów mikrosatelitarnych u z 7 innych pacjentów (tabela S5 w dodatkowym dodatku); tak więc utratę heterozygotyczności wykryto przy 16p u 8 z 33 pacjentów (24%) z niezależnym od kortykotropiny makronodularnym przerostem kory nadnerczy.
Sekwencjonowanie całego genomu w pięciu sparowanych próbkach DNA guza i leukocytów zidentyfikowało mutacje somatyczne wpływające na sekwencję kodującą 85 genów i warianty strukturalne wpływające na sekwencję kodującą 12 genów (Tabele S6, S7 i S8 w Dodatku Uzupełniającym). Tylko gen, ARMC5, który mapuje do 16p11.2, został zmodyfikowany w więcej niż jednej próbce guza; Próbki guza uzyskane od trzech pacjentów miały mutację. Mutacje somatyczne ARMC5 obejmowały dwie mutacje zmiany ramki odczytu i jedną mutację missense. Mutacje te potwierdzono za pomocą sekwencjonowania Sangera.
Figura 2. Figura 2. Zmiany ARMC5 w DNA leukocytów i guza. Panel A pokazuje dwie zmiany ARMC5 wykryte w DNA nowotworu uzyskane od 18 pacjentów. Analiza DNA leukocytów (lewa kolumna) pokazuje zmianę linii płciowej (niebieskie pole). Każdy nowotwór pod Warianty somatyczne w różnych nowotworach pokazano jako pudełko z niebieskim prostokątem (pokazującym zmianę w DNA leukocytów) i żółtym prostokącie (pokazującym zmianę, która jest wykrywana tylko w DNA nowotworu). DNA linii komórkowej od 4 pacjentów nie było dostępne (prawy dolny róg). Panel B pokazuje analizę Western blot białka ARMC5 w ludzkiej linii komórkowej adrenokortów H295R transfekowanych kontrolnym małym interferującym RNA (siRNA) lub siRNA ARMC5 (po lewej), 3 prawidłowymi gruczołami nadnerczy (w środku) i 17 próbami uzyskanymi od pacjentów z niezależnym od kortykotropiny makronodularnym przerost nadnerczy (po prawej): 7 bez zmiany ARMC5 i 10 z różnymi typami zmian ARMC5. LOH oznacza utratę heterozygotyczności, LT lewego guza i RT prawego guza.
Bezpośrednie sekwencjonowanie DNA nowotworu zidentyfikowało mutacje ARMC5 u 18 z 33 pacjentów (55%)
[hasła pokrewne: kalendarz zbioru ziół, przeciwwskazania do masażu, medycyna na ukrainie opinie ]

Powiązane tematy z artykułem: kalendarz zbioru ziół medycyna na ukrainie opinie przeciwwskazania do masażu